Na zbiorniku Goczałkowickim wystąpił zakwit sinic czyli organizmów samożywnych. Początkowo były one zaliczane do roślin, a obecnie do prokariotów znajdujących się w królestwie bakterii. Stan taki ma miejsce, ponieważ wpływa na to wiele czynników, takich jak wysoka temperatura wody, delikatne falowanie wody lub jego brak, brak opadów, a także dostęp do azotanów i fosforanów przyspieszających proces rozmnażania sinic.

Sinice pojawiają się także w zbiornikach zaporowych, w których występuje duża eutrofizacja. W obecnych czasach pogodowych i braku opadów jest to zjawisko naturalne, które będzie występowało na dużych żyznych zbiornikach zaporowych. Dobrą wiadomością jest to, że jest to proces odwracalny i gdy tylko obniżą się temperatury, będzie dopływ wody opadowej i falowanie wody, zakwit sinic zniknie.

Odnosząc się do informacji o śniętych rybach, można stwierdzić kilka przyczyn takich, jak wysoka temperatura wody, czyli mała zawartość rozpuszczonego tlenu w wodzie - tzw. przyducha. Również wpływają na to ataki kormorana czarnego, który gniazduje w bardzo dużej ilości na zbiorniku Goczałkowickim i podczas żerowania zagania ryby, które pod wpływem stresu i poniesionych uszkodzeń powłok ciała, mogą padać. Jest to drapieżnik, który podczas żerowania niszczy bardzo dużo ryb. Trzecim i bardzo powszechnym aspektem, który coraz częściej występuje, jest kłusownictwo. Proces ten powoduje, że bardzo dużo ryb ulega zniszczeniu przez użyty sprzęt i metody kłusownicze.